Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H2-M3Q31093 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-M3Q31093 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-M3Q31093 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-M3Q31093 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms