Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shisal1Q0VBP7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shisal1Q0VBP7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shisal1Q0VBP7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 342.5 ms