Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cntnap5aQ0V8T9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cntnap5aQ0V8T9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntnap5aQ0V8T9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntnap5aQ0V8T9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntnap5aQ0V8T9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntnap5aQ0V8T9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntnap5aQ0V8T9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms