Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Znf541Q0GGX2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Znf541Q0GGX2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Znf541Q0GGX2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Znf541Q0GGX2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Znf541Q0GGX2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Znf541Q0GGX2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Znf541Q0GGX2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Znf541Q0GGX2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Znf541Q0GGX2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Znf541Q0GGX2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Znf541Q0GGX2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Znf541Q0GGX2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Znf541Q0GGX2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Znf541Q0GGX2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Znf541Q0GGX2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Znf541Q0GGX2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Znf541Q0GGX2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Znf541Q0GGX2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Znf541Q0GGX2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Znf541Q0GGX2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Znf541Q0GGX2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Znf541Q0GGX2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Znf541Q0GGX2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Znf541Q0GGX2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Znf541Q0GGX2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Znf541Q0GGX2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Znf541Q0GGX2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Znf541Q0GGX2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Znf541Q0GGX2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Znf541Q0GGX2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Znf541Q0GGX2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Znf541Q0GGX2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Znf541Q0GGX2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Znf541Q0GGX2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Znf541Q0GGX2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Znf541Q0GGX2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Znf541Q0GGX2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Znf541Q0GGX2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Znf541Q0GGX2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Znf541Q0GGX2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Znf541Q0GGX2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Znf541Q0GGX2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Znf541Q0GGX2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Znf541Q0GGX2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Znf541Q0GGX2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Znf541Q0GGX2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Znf541Q0GGX2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Znf541Q0GGX2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Znf541Q0GGX2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Znf541Q0GGX2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Znf541Q0GGX2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Znf541Q0GGX2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Znf541Q0GGX2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Znf541Q0GGX2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Znf541Q0GGX2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Znf541Q0GGX2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Znf541Q0GGX2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Znf541Q0GGX2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Znf541Q0GGX2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Znf541Q0GGX2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Znf541Q0GGX2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Znf541Q0GGX2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Znf541Q0GGX2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Znf541Q0GGX2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Znf541Q0GGX2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Znf541Q0GGX2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Znf541Q0GGX2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Znf541Q0GGX2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Znf541Q0GGX2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Znf541Q0GGX2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Znf541Q0GGX2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Znf541Q0GGX2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Znf541Q0GGX2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Znf541Q0GGX2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Znf541Q0GGX2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Znf541Q0GGX2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Znf541Q0GGX2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Znf541Q0GGX2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Znf541Q0GGX2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Znf541Q0GGX2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Znf541Q0GGX2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Znf541Q0GGX2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Znf541Q0GGX2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Znf541Q0GGX2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Znf541Q0GGX2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Znf541Q0GGX2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Znf541Q0GGX2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Znf541Q0GGX2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Znf541Q0GGX2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms