Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MitfQ08874 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MitfQ08874 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MitfQ08874 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MitfQ08874 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MitfQ08874 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MitfQ08874 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MitfQ08874 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MitfQ08874 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MitfQ08874 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MitfQ08874 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MitfQ08874 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MitfQ08874 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MitfQ08874 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MitfQ08874 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MitfQ08874 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MitfQ08874 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MitfQ08874 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MitfQ08874 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MitfQ08874 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MitfQ08874 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MitfQ08874 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MitfQ08874 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MitfQ08874 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MitfQ08874 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MitfQ08874 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MitfQ08874 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MitfQ08874 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MitfQ08874 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MitfQ08874 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MitfQ08874 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MitfQ08874 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MitfQ08874 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MitfQ08874 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MitfQ08874 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MitfQ08874 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms