Protein–RNA interactions for Protein: Q08639

Tfdp1, Transcription factor Dp-1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp1Q08639 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfdp1Q08639 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tfdp1Q08639 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tfdp1Q08639 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tfdp1Q08639 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tfdp1Q08639 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tfdp1Q08639 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tfdp1Q08639 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms