Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col9a2Q07643 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col9a2Q07643 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col9a2Q07643 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col9a2Q07643 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col9a2Q07643 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col9a2Q07643 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col9a2Q07643 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col9a2Q07643 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col9a2Q07643 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col9a2Q07643 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col9a2Q07643 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col9a2Q07643 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col9a2Q07643 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Col9a2Q07643 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col9a2Q07643 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Col9a2Q07643 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col9a2Q07643 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col9a2Q07643 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col9a2Q07643 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col9a2Q07643 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col9a2Q07643 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col9a2Q07643 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col9a2Q07643 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Col9a2Q07643 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col9a2Q07643 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col9a2Q07643 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col9a2Q07643 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col9a2Q07643 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col9a2Q07643 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col9a2Q07643 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Col9a2Q07643 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col9a2Q07643 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col9a2Q07643 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms