Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdx4Q07424 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdx4Q07424 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms