Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dnal1Q05A62 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dnal1Q05A62 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Dnal1Q05A62 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dnal1Q05A62 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms