Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdr16c6Q05A13 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdr16c6Q05A13 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdr16c6Q05A13 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdr16c6Q05A13 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms