Protein–RNA interactions for Protein: Q03401

Crisp1, Cysteine-rich secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp1Q03401 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Crisp1Q03401 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Crisp1Q03401 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Crisp1Q03401 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Crisp1Q03401 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Crisp1Q03401 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Crisp1Q03401 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms