Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epha4Q03137 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Epha4Q03137 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Epha4Q03137 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Epha4Q03137 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Epha4Q03137 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Epha4Q03137 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Epha4Q03137 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Epha4Q03137 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Epha4Q03137 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epha4Q03137 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epha4Q03137 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epha4Q03137 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epha4Q03137 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Epha4Q03137 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epha4Q03137 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epha4Q03137 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epha4Q03137 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Epha4Q03137 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epha4Q03137 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epha4Q03137 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Epha4Q03137 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epha4Q03137 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epha4Q03137 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epha4Q03137 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epha4Q03137 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Epha4Q03137 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epha4Q03137 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epha4Q03137 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Epha4Q03137 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epha4Q03137 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms