Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb5Q02739 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb5Q02739 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb5Q02739 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb5Q02739 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb5Q02739 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gjb5Q02739 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb5Q02739 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb5Q02739 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gjb5Q02739 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb5Q02739 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb5Q02739 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb5Q02739 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb5Q02739 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gjb5Q02739 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb5Q02739 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb5Q02739 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gjb5Q02739 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb5Q02739 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb5Q02739 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gjb5Q02739 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb5Q02739 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb5Q02739 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms