Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp10Q000W5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp10Q000W5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp10Q000W5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp10Q000W5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp10Q000W5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp10Q000W5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp10Q000W5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp10Q000W5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp10Q000W5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp10Q000W5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp10Q000W5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp10Q000W5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp10Q000W5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp10Q000W5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp10Q000W5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp10Q000W5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp10Q000W5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp10Q000W5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp10Q000W5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp10Q000W5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbp10Q000W5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gbp10Q000W5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbp10Q000W5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms