Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VegfcP97953 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VegfcP97953 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VegfcP97953 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfcP97953 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfcP97953 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfcP97953 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfcP97953 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VegfcP97953 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VegfcP97953 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VegfcP97953 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VegfcP97953 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VegfcP97953 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfcP97953 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VegfcP97953 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VegfcP97953 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 811.8 ms