Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tarbp2P97473 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tarbp2P97473 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tarbp2P97473 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tarbp2P97473 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tarbp2P97473 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tarbp2P97473 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tarbp2P97473 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tarbp2P97473 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tarbp2P97473 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tarbp2P97473 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tarbp2P97473 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tarbp2P97473 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tarbp2P97473 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tarbp2P97473 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tarbp2P97473 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tarbp2P97473 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tarbp2P97473 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tarbp2P97473 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tarbp2P97473 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tarbp2P97473 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tarbp2P97473 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tarbp2P97473 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tarbp2P97473 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tarbp2P97473 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tarbp2P97473 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tarbp2P97473 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tarbp2P97473 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tarbp2P97473 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tarbp2P97473 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tarbp2P97473 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tarbp2P97473 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tarbp2P97473 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tarbp2P97473 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tarbp2P97473 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tarbp2P97473 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tarbp2P97473 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tarbp2P97473 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tarbp2P97473 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms