Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Meis3P97368 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Meis3P97368 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Meis3P97368 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Meis3P97368 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Meis3P97368 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Meis3P97368 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Meis3P97368 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Meis3P97368 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Meis3P97368 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Meis3P97368 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Meis3P97368 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Meis3P97368 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Meis3P97368 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Meis3P97368 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Meis3P97368 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Meis3P97368 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Meis3P97368 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Meis3P97368 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Meis3P97368 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Meis3P97368 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Meis3P97368 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Meis3P97368 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Meis3P97368 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Meis3P97368 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Meis3P97368 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Meis3P97368 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Meis3P97368 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Meis3P97368 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Meis3P97368 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Meis3P97368 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Meis3P97368 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Meis3P97368 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Meis3P97368 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Meis3P97368 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Meis3P97368 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Meis3P97368 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis3P97368 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis3P97368 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms