Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp4P70343 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp4P70343 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp4P70343 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp4P70343 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp4P70343 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Casp4P70343 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp4P70343 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp4P70343 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp4P70343 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp4P70343 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp4P70343 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms