Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sumo1P63166 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sumo1P63166 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sumo1P63166 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sumo1P63166 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sumo1P63166 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sumo1P63166 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sumo1P63166 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sumo1P63166 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sumo1P63166 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sumo1P63166 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sumo1P63166 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sumo1P63166 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sumo1P63166 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sumo1P63166 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sumo1P63166 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sumo1P63166 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sumo1P63166 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sumo1P63166 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sumo1P63166 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms