Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp2P63044 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp2P63044 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp2P63044 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp2P63044 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms