Protein–RNA interactions for Protein: P62754

Rps6, 40S ribosomal protein S6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6P62754 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps6P62754 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps6P62754 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps6P62754 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps6P62754 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps6P62754 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rps6P62754 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rps6P62754 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rps6P62754 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rps6P62754 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rps6P62754 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6P62754 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6P62754 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6P62754 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6P62754 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6P62754 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6P62754 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rps6P62754 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rps6P62754 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rps6P62754 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6P62754 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6P62754 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rps6P62754 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms