Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hpcal1P62748 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hpcal1P62748 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hpcal1P62748 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hpcal1P62748 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hpcal1P62748 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms