Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rps29P62274 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rps29P62274 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rps29P62274 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rps29P62274 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rps29P62274 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rps29P62274 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rps29P62274 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rps29P62274 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rps29P62274 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps29P62274 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps29P62274 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps29P62274 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rps29P62274 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rps29P62274 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rps29P62274 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rps29P62274 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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