Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SnnP61807 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SnnP61807 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SnnP61807 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SnnP61807 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SnnP61807 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SnnP61807 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SnnP61807 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SnnP61807 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SnnP61807 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnnP61807 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnnP61807 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnnP61807 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnnP61807 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SnnP61807 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SnnP61807 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SnnP61807 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SnnP61807 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnnP61807 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SnnP61807 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnnP61807 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnnP61807 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SnnP61807 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnnP61807 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SnnP61807 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SnnP61807 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SnnP61807 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SnnP61807 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SnnP61807 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SnnP61807 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SnnP61807 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SnnP61807 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SnnP61807 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SnnP61807 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SnnP61807 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SnnP61807 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SnnP61807 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SnnP61807 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SnnP61807 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SnnP61807 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SnnP61807 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SnnP61807 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SnnP61807 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SnnP61807 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SnnP61807 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SnnP61807 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SnnP61807 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SnnP61807 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnnP61807 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnnP61807 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnnP61807 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnnP61807 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnnP61807 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SnnP61807 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SnnP61807 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SnnP61807 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SnnP61807 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SnnP61807 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SnnP61807 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SnnP61807 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnnP61807 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SnnP61807 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SnnP61807 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SnnP61807 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SnnP61807 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SnnP61807 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SnnP61807 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SnnP61807 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SnnP61807 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SnnP61807 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SnnP61807 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SnnP61807 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SnnP61807 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SnnP61807 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SnnP61807 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SnnP61807 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SnnP61807 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SnnP61807 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SnnP61807 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SnnP61807 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SnnP61807 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SnnP61807 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SnnP61807 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SnnP61807 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SnnP61807 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SnnP61807 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SnnP61807 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SnnP61807 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SnnP61807 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SnnP61807 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SnnP61807 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SnnP61807 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SnnP61807 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SnnP61807 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SnnP61807 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SnnP61807 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SnnP61807 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SnnP61807 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SnnP61807 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SnnP61807 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1246.9 ms