Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd6P61407 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tdrd6P61407 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd6P61407 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tdrd6P61407 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd6P61407 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd6P61407 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd6P61407 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd6P61407 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tdrd6P61407 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tdrd6P61407 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd6P61407 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd6P61407 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd6P61407 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd6P61407 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd6P61407 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd6P61407 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tdrd6P61407 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd6P61407 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tdrd6P61407 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms