Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sem1P60897 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sem1P60897 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sem1P60897 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sem1P60897 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sem1P60897 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sem1P60897 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sem1P60897 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sem1P60897 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms