Protein–RNA interactions for Protein: P59672

Anks1a, Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Anks1aP59672 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Anks1aP59672 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Anks1aP59672 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Anks1aP59672 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Anks1aP59672 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Anks1aP59672 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Anks1aP59672 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Anks1aP59672 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Anks1aP59672 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Anks1aP59672 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Anks1aP59672 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Anks1aP59672 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Anks1aP59672 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Anks1aP59672 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Anks1aP59672 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Anks1aP59672 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Anks1aP59672 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Anks1aP59672 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Anks1aP59672 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Anks1aP59672 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Anks1aP59672 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Anks1aP59672 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Anks1aP59672 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Anks1aP59672 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Anks1aP59672 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Anks1aP59672 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Anks1aP59672 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Anks1aP59672 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Anks1aP59672 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Anks1aP59672 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Anks1aP59672 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Anks1aP59672 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Anks1aP59672 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Anks1aP59672 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Anks1aP59672 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Anks1aP59672 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Anks1aP59672 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Anks1aP59672 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Anks1aP59672 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Anks1aP59672 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Anks1aP59672 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Anks1aP59672 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Anks1aP59672 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Anks1aP59672 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Anks1aP59672 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Anks1aP59672 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Anks1aP59672 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Anks1aP59672 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Anks1aP59672 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Anks1aP59672 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Anks1aP59672 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Anks1aP59672 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Anks1aP59672 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Anks1aP59672 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Anks1aP59672 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Anks1aP59672 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Anks1aP59672 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Anks1aP59672 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Anks1aP59672 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Anks1aP59672 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Anks1aP59672 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Anks1aP59672 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Anks1aP59672 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Anks1aP59672 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Anks1aP59672 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Anks1aP59672 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Anks1aP59672 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Anks1aP59672 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms