Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Nphp4P59240 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Nphp4P59240 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.57
Nphp4P59240 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Nphp4P59240 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Nphp4P59240 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Nphp4P59240 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Nphp4P59240 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Nphp4P59240 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Nphp4P59240 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Nphp4P59240 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nphp4P59240 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nphp4P59240 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nphp4P59240 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nphp4P59240 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Nphp4P59240 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nphp4P59240 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Nphp4P59240 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Nphp4P59240 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Nphp4P59240 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Nphp4P59240 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nphp4P59240 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nphp4P59240 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nphp4P59240 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nphp4P59240 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nphp4P59240 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Nphp4P59240 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Nphp4P59240 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Nphp4P59240 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Nphp4P59240 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Nphp4P59240 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Nphp4P59240 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Nphp4P59240 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Nphp4P59240 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Nphp4P59240 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Nphp4P59240 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Nphp4P59240 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Nphp4P59240 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Nphp4P59240 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Nphp4P59240 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Nphp4P59240 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nphp4P59240 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nphp4P59240 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nphp4P59240 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nphp4P59240 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Nphp4P59240 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nphp4P59240 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nphp4P59240 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Nphp4P59240 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms