Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Setd4P58467 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setd4P58467 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Setd4P58467 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setd4P58467 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Setd4P58467 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Setd4P58467 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Setd4P58467 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd4P58467 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setd4P58467 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setd4P58467 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd4P58467 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms