Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn18P56857 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn18P56857 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn18P56857 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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