Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PltpP55065 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PltpP55065 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PltpP55065 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PltpP55065 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PltpP55065 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PltpP55065 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PltpP55065 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PltpP55065 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PltpP55065 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PltpP55065 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PltpP55065 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PltpP55065 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PltpP55065 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PltpP55065 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PltpP55065 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PltpP55065 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PltpP55065 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PltpP55065 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PltpP55065 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PltpP55065 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PltpP55065 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PltpP55065 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PltpP55065 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PltpP55065 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PltpP55065 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PltpP55065 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PltpP55065 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PltpP55065 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PltpP55065 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PltpP55065 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PltpP55065 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PltpP55065 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PltpP55065 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PltpP55065 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PltpP55065 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PltpP55065 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PltpP55065 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PltpP55065 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PltpP55065 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PltpP55065 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PltpP55065 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PltpP55065 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PltpP55065 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PltpP55065 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PltpP55065 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PltpP55065 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PltpP55065 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PltpP55065 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PltpP55065 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PltpP55065 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PltpP55065 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PltpP55065 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PltpP55065 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PltpP55065 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PltpP55065 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PltpP55065 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PltpP55065 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PltpP55065 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PltpP55065 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PltpP55065 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PltpP55065 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PltpP55065 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PltpP55065 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PltpP55065 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PltpP55065 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PltpP55065 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PltpP55065 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PltpP55065 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PltpP55065 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PltpP55065 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PltpP55065 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PltpP55065 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PltpP55065 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PltpP55065 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PltpP55065 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PltpP55065 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PltpP55065 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PltpP55065 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PltpP55065 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PltpP55065 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PltpP55065 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PltpP55065 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PltpP55065 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PltpP55065 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PltpP55065 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PltpP55065 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PltpP55065 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PltpP55065 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PltpP55065 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PltpP55065 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PltpP55065 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PltpP55065 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PltpP55065 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PltpP55065 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PltpP55065 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PltpP55065 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PltpP55065 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PltpP55065 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PltpP55065 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms