Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt6aP50446 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt6aP50446 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt6aP50446 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt6aP50446 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt6aP50446 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt6aP50446 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt6aP50446 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt6aP50446 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt6aP50446 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt6aP50446 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt6aP50446 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt6aP50446 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt6aP50446 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt6aP50446 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt6aP50446 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt6aP50446 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt6aP50446 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt6aP50446 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt6aP50446 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt6aP50446 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt6aP50446 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt6aP50446 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt6aP50446 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt6aP50446 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms