Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ercc3P49135 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ercc3P49135 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ercc3P49135 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ercc3P49135 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ercc3P49135 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ercc3P49135 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ercc3P49135 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ercc3P49135 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ercc3P49135 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ercc3P49135 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ercc3P49135 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc3P49135 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ercc3P49135 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ercc3P49135 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ercc3P49135 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ercc3P49135 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc3P49135 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc3P49135 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc3P49135 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc3P49135 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms