Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Zic1P46684 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Zic1P46684 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zic1P46684 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zic1P46684 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zic1P46684 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zic1P46684 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zic1P46684 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zic1P46684 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zic1P46684 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Zic1P46684 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zic1P46684 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zic1P46684 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Zic1P46684 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms