Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VhlP40338 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VhlP40338 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VhlP40338 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VhlP40338 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VhlP40338 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VhlP40338 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VhlP40338 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VhlP40338 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VhlP40338 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VhlP40338 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VhlP40338 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VhlP40338 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VhlP40338 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VhlP40338 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VhlP40338 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VhlP40338 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VhlP40338 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VhlP40338 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VhlP40338 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VhlP40338 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VhlP40338 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VhlP40338 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VhlP40338 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VhlP40338 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VhlP40338 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VhlP40338 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VhlP40338 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VhlP40338 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VhlP40338 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VhlP40338 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VhlP40338 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VhlP40338 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VhlP40338 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VhlP40338 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VhlP40338 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VhlP40338 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VhlP40338 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VhlP40338 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VhlP40338 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VhlP40338 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VhlP40338 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VhlP40338 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VhlP40338 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VhlP40338 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VhlP40338 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VhlP40338 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VhlP40338 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VhlP40338 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VhlP40338 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VhlP40338 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VhlP40338 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VhlP40338 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VhlP40338 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VhlP40338 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VhlP40338 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VhlP40338 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VhlP40338 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VhlP40338 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VhlP40338 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VhlP40338 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VhlP40338 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VhlP40338 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VhlP40338 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VhlP40338 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VhlP40338 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VhlP40338 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VhlP40338 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VhlP40338 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VhlP40338 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VhlP40338 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VhlP40338 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VhlP40338 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VhlP40338 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VhlP40338 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VhlP40338 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VhlP40338 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VhlP40338 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VhlP40338 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VhlP40338 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VhlP40338 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VhlP40338 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VhlP40338 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VhlP40338 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VhlP40338 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VhlP40338 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VhlP40338 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VhlP40338 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VhlP40338 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VhlP40338 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VhlP40338 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VhlP40338 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VhlP40338 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VhlP40338 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VhlP40338 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VhlP40338 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VhlP40338 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VhlP40338 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VhlP40338 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VhlP40338 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms