Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grik2P39087 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik2P39087 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik2P39087 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik2P39087 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grik2P39087 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grik2P39087 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grik2P39087 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grik2P39087 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik2P39087 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik2P39087 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grik2P39087 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grik2P39087 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grik2P39087 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grik2P39087 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Grik2P39087 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grik2P39087 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms