Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sar1aP36536 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sar1aP36536 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sar1aP36536 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sar1aP36536 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sar1aP36536 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sar1aP36536 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sar1aP36536 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Sar1aP36536 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sar1aP36536 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sar1aP36536 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sar1aP36536 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sar1aP36536 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sar1aP36536 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sar1aP36536 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sar1aP36536 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sar1aP36536 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sar1aP36536 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sar1aP36536 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sar1aP36536 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sar1aP36536 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sar1aP36536 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sar1aP36536 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sar1aP36536 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sar1aP36536 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sar1aP36536 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sar1aP36536 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sar1aP36536 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sar1aP36536 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sar1aP36536 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sar1aP36536 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sar1aP36536 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sar1aP36536 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sar1aP36536 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sar1aP36536 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sar1aP36536 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sar1aP36536 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sar1aP36536 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sar1aP36536 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sar1aP36536 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sar1aP36536 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sar1aP36536 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.5 ms