Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ly6dP35459 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ly6dP35459 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ly6dP35459 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ly6dP35459 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ly6dP35459 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ly6dP35459 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ly6dP35459 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ly6dP35459 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ly6dP35459 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ly6dP35459 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ly6dP35459 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ly6dP35459 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ly6dP35459 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ly6dP35459 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ly6dP35459 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ly6dP35459 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ly6dP35459 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ly6dP35459 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ly6dP35459 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ly6dP35459 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ly6dP35459 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ly6dP35459 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ly6dP35459 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ly6dP35459 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ly6dP35459 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ly6dP35459 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ly6dP35459 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ly6dP35459 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ly6dP35459 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ly6dP35459 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ly6dP35459 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ly6dP35459 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ly6dP35459 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ly6dP35459 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ly6dP35459 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ly6dP35459 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ly6dP35459 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ly6dP35459 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ly6dP35459 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ly6dP35459 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ly6dP35459 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ly6dP35459 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ly6dP35459 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ly6dP35459 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ly6dP35459 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ly6dP35459 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ly6dP35459 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ly6dP35459 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ly6dP35459 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ly6dP35459 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ly6dP35459 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ly6dP35459 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ly6dP35459 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ly6dP35459 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ly6dP35459 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ly6dP35459 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ly6dP35459 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ly6dP35459 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ly6dP35459 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ly6dP35459 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ly6dP35459 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ly6dP35459 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ly6dP35459 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ly6dP35459 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ly6dP35459 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms