Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Apoc3P33622 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apoc3P33622 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoc3P33622 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc3P33622 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms