Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Pola1P33609 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Pola1P33609 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Pola1P33609 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Pola1P33609 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Pola1P33609 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Pola1P33609 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Pola1P33609 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Pola1P33609 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Pola1P33609 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Pola1P33609 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Pola1P33609 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Pola1P33609 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Pola1P33609 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Pola1P33609 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Pola1P33609 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Pola1P33609 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Pola1P33609 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Pola1P33609 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Pola1P33609 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Pola1P33609 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Pola1P33609 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Pola1P33609 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Pola1P33609 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Pola1P33609 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Pola1P33609 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Pola1P33609 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Pola1P33609 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Pola1P33609 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Pola1P33609 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pola1P33609 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pola1P33609 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pola1P33609 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pola1P33609 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Pola1P33609 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Pola1P33609 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Pola1P33609 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Pola1P33609 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Pola1P33609 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Pola1P33609 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Pola1P33609 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Pola1P33609 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pola1P33609 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pola1P33609 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pola1P33609 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Pola1P33609 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Pola1P33609 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Pola1P33609 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Pola1P33609 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pola1P33609 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pola1P33609 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pola1P33609 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pola1P33609 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pola1P33609 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Pola1P33609 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Pola1P33609 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Pola1P33609 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Pola1P33609 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Pola1P33609 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Pola1P33609 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Pola1P33609 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Pola1P33609 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pola1P33609 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pola1P33609 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Pola1P33609 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pola1P33609 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pola1P33609 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pola1P33609 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pola1P33609 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pola1P33609 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pola1P33609 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pola1P33609 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Pola1P33609 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pola1P33609 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Pola1P33609 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Pola1P33609 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Pola1P33609 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms