Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxa11P31311 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxa11P31311 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxa11P31311 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxa11P31311 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxa11P31311 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxa11P31311 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxa11P31311 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxa11P31311 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxa11P31311 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxa11P31311 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxa11P31311 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxa11P31311 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxa11P31311 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxa11P31311 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxa11P31311 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxa11P31311 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxa11P31311 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxa11P31311 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxa11P31311 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxa11P31311 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxa11P31311 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxa11P31311 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxa11P31311 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxa11P31311 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxa11P31311 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxa11P31311 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxa11P31311 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxa11P31311 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxa11P31311 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxa11P31311 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxa11P31311 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxa11P31311 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxa11P31311 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hoxa11P31311 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hoxa11P31311 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hoxa11P31311 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hoxa11P31311 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxa11P31311 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxa11P31311 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxa11P31311 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxa11P31311 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxa11P31311 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxa11P31311 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxa11P31311 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxa11P31311 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms