Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TbpP29037 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TbpP29037 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TbpP29037 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TbpP29037 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TbpP29037 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TbpP29037 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TbpP29037 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TbpP29037 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TbpP29037 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TbpP29037 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TbpP29037 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TbpP29037 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TbpP29037 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TbpP29037 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TbpP29037 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TbpP29037 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TbpP29037 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TbpP29037 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TbpP29037 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TbpP29037 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TbpP29037 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TbpP29037 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TbpP29037 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TbpP29037 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TbpP29037 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TbpP29037 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TbpP29037 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TbpP29037 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TbpP29037 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TbpP29037 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TbpP29037 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TbpP29037 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TbpP29037 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TbpP29037 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TbpP29037 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TbpP29037 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TbpP29037 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TbpP29037 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TbpP29037 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TbpP29037 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TbpP29037 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TbpP29037 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TbpP29037 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TbpP29037 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TbpP29037 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TbpP29037 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TbpP29037 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TbpP29037 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TbpP29037 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TbpP29037 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TbpP29037 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TbpP29037 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TbpP29037 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TbpP29037 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TbpP29037 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TbpP29037 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TbpP29037 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TbpP29037 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TbpP29037 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TbpP29037 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TbpP29037 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TbpP29037 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TbpP29037 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TbpP29037 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TbpP29037 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TbpP29037 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TbpP29037 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TbpP29037 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TbpP29037 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TbpP29037 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TbpP29037 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TbpP29037 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TbpP29037 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TbpP29037 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TbpP29037 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TbpP29037 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TbpP29037 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TbpP29037 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TbpP29037 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TbpP29037 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TbpP29037 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TbpP29037 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TbpP29037 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TbpP29037 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TbpP29037 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TbpP29037 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TbpP29037 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TbpP29037 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TbpP29037 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TbpP29037 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TbpP29037 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TbpP29037 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TbpP29037 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TbpP29037 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TbpP29037 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TbpP29037 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TbpP29037 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TbpP29037 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TbpP29037 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms