Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mmp3P28862 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp3P28862 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp3P28862 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp3P28862 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Mmp3P28862 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp3P28862 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp3P28862 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mmp3P28862 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.7 ms