Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Kif3aP28741 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Kif3aP28741 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kif3aP28741 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kif3aP28741 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kif3aP28741 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kif3aP28741 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kif3aP28741 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kif3aP28741 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kif3aP28741 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kif3aP28741 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kif3aP28741 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kif3aP28741 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kif3aP28741 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kif3aP28741 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kif3aP28741 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kif3aP28741 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kif3aP28741 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kif3aP28741 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms