Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc6a9P28571 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc6a9P28571 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc6a9P28571 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc6a9P28571 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc6a9P28571 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc6a9P28571 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc6a9P28571 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc6a9P28571 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc6a9P28571 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc6a9P28571 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc6a9P28571 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc6a9P28571 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc6a9P28571 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc6a9P28571 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc6a9P28571 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc6a9P28571 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc6a9P28571 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc6a9P28571 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc6a9P28571 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms