Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dusp1P28563 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Dusp1P28563 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dusp1P28563 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dusp1P28563 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dusp1P28563 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms