Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prim1P20664 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prim1P20664 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prim1P20664 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prim1P20664 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prim1P20664 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prim1P20664 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prim1P20664 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prim1P20664 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prim1P20664 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Prim1P20664 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Prim1P20664 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Prim1P20664 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prim1P20664 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prim1P20664 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prim1P20664 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prim1P20664 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prim1P20664 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prim1P20664 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prim1P20664 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prim1P20664 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prim1P20664 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prim1P20664 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prim1P20664 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prim1P20664 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Prim1P20664 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prim1P20664 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prim1P20664 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Prim1P20664 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prim1P20664 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Prim1P20664 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prim1P20664 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prim1P20664 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prim1P20664 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Prim1P20664 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prim1P20664 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prim1P20664 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prim1P20664 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prim1P20664 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prim1P20664 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prim1P20664 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prim1P20664 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prim1P20664 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prim1P20664 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prim1P20664 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prim1P20664 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prim1P20664 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prim1P20664 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prim1P20664 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prim1P20664 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Prim1P20664 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prim1P20664 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prim1P20664 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prim1P20664 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prim1P20664 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prim1P20664 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prim1P20664 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prim1P20664 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prim1P20664 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prim1P20664 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prim1P20664 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prim1P20664 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prim1P20664 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Prim1P20664 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prim1P20664 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prim1P20664 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prim1P20664 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prim1P20664 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prim1P20664 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prim1P20664 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prim1P20664 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prim1P20664 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prim1P20664 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prim1P20664 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prim1P20664 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prim1P20664 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prim1P20664 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prim1P20664 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prim1P20664 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prim1P20664 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prim1P20664 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prim1P20664 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prim1P20664 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prim1P20664 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prim1P20664 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prim1P20664 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Prim1P20664 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prim1P20664 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prim1P20664 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prim1P20664 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prim1P20664 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prim1P20664 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prim1P20664 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prim1P20664 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prim1P20664 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prim1P20664 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prim1P20664 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prim1P20664 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Prim1P20664 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prim1P20664 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms