Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fcer1aP20489 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fcer1aP20489 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fcer1aP20489 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fcer1aP20489 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms