Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou5f1P20263 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou5f1P20263 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou5f1P20263 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou5f1P20263 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pou5f1P20263 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pou5f1P20263 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou5f1P20263 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou5f1P20263 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou5f1P20263 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou5f1P20263 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou5f1P20263 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou5f1P20263 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pou5f1P20263 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pou5f1P20263 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pou5f1P20263 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pou5f1P20263 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pou5f1P20263 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou5f1P20263 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou5f1P20263 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou5f1P20263 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou5f1P20263 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou5f1P20263 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pou5f1P20263 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou5f1P20263 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou5f1P20263 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pou5f1P20263 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms