Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P18528 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P18528 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
P18528 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P18528 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P18528 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P18528 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P18528 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P18528 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P18528 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P18528 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P18528 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P18528 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P18528 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P18528 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P18528 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P18528 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P18528 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P18528 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P18528 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P18528 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P18528 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P18528 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P18528 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P18528 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P18528 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
P18528 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P18528 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P18528 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P18528 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P18528 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P18528 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P18528 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P18528 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P18528 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P18528 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P18528 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P18528 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P18528 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P18528 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P18528 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P18528 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P18528 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P18528 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P18528 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P18528 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P18528 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P18528 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P18528 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P18528 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P18528 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P18528 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P18528 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P18528 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P18528 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P18528 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P18528 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P18528 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P18528 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P18528 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P18528 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P18528 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P18528 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P18528 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
P18528 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P18528 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P18528 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P18528 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P18528 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P18528 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P18528 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P18528 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P18528 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P18528 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P18528 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P18528 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P18528 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P18528 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P18528 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P18528 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P18528 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P18528 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P18528 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P18528 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P18528 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
P18528 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P18528 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P18528 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P18528 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P18528 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P18528 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P18528 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P18528 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P18528 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P18528 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P18528 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P18528 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P18528 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P18528 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P18528 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms